• 中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院骨科运动医学中心(重庆 400038);
导出 下载 收藏 扫码 引用

目的 探究肩袖腱病中差异表达的环状 RNA(circular RNA,circRNA)及其调控靶基因的预测和生物信息学分析。方法 取 2018 年 6 月—2019 年 6 月因冈上肌腱损伤行手术治疗的 10 例患者自愿捐赠肩袖组织,经 MRI、关节镜检查以及组织学染色,确定为正常肩袖或肩袖腱病组织,再依据患者年龄、体质量以及 Bonar 评分进行配对分组。通过高通量测序对肩袖组织进行 circRNA 检测,筛选差异表达的 circRNA,对 circRNA 靶基因进行预测,并进行富集分析和内源竞争 RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络构建。结果 在 P<0.05、log2 差异表达倍数(fold change,FC)绝对值>2 条件下,共筛选出 94 条在正常肩袖及肩袖腱病组织中差异表达的 circRNA,其中肩袖腱病组织中有 31 条表达上调、63 条表达下调。基因本体(gene ontology,GO)分析发现差异基因最显著富集于环磷酸腺苷应答;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析发现,差异基因主要富集在细胞外基质-受体交互、蛋白消化及吸收、细胞循环、NF-κB 信号通路等。ceRNA 网络揭示了差异表达的 circRNA 和 miRNA、mRNA 之间可能的相互作用,其中自由能最高的 ceRNA 调控轴为 circRNA.8951-has-miR-6089-DNMT3B。结论 肩袖腱病中存在差异表达的 circRNA,可能与肩袖腱病发生发展密切相关,有望为临床诊断、治疗提供潜在靶点。

引用本文: 葛子路, 周兵华, 郑小龙, 杨明宇, 吕晶同, 邓泓鄗, 唐康来, 陈万. 肩袖腱病环状 RNA 表达特征与内源竞争 RNA 调控网络构建的研究. 中国修复重建外科杂志, 2020, 34(5): 608-614. doi: 10.7507/1002-1892.201911094 复制

  • 上一篇

    Latarjet 手术治疗肩关节前向脱位中螺钉固定与纽扣固定的生物力学对比分析
  • 下一篇

    钴铬颗粒刺激制备小鼠膝关节假体无菌性松动模型的研究